南酸棗樹的整形，一般可采用自然開心形或主干疏層形。

1、自然開心形，苗木種植后在80-100厘米處定干，當(dāng)年留主枝3-4個，其余抹除，主枝的位置和角度要分配適當(dāng)，主枝生長的角度以50-60度斜生為宜。第二年春季萌芽前修剪時，再將主枝留60-80厘米處進(jìn)行短截，并在主枝的兩側(cè)選留2-3個側(cè)枝，培養(yǎng)成副主枝:2-3年后即形成樹冠的骨架。

2、主干疏層形：苗木種植后在主干高100-120厘米處定干，長出分枝后，以上端的枝條作為中心主干延長枝，以3~4個枝條作為主枝。以后逐年留主干延長枝及第二，三層主枝，每層可留2~3個主枝。每個主枝留2個側(cè)枝，方向錯開。每層距離100-120厘米，層內(nèi)主枝距離約10~15厘米左右，3-4年后樹冠骨架基本形成。

3、修剪:對幼樹的修剪可迅速擴(kuò)大樹冠，增加有效枝量，幼齡樹有三叉枝、四叉枝的習(xí)性，要留強(qiáng)疏弱，疏去其余。其修剪的原則是疏而不截。對強(qiáng)壯枝條，只要方位適宜，盡量保留。

南酸棗5-8年樹結(jié)果以后，結(jié)果部位外移，樹冠不斷擴(kuò)展，內(nèi)堂空虛，結(jié)果母枝數(shù)量減少，產(chǎn)量不穩(wěn)，對這類樹修剪主要是回縮主枝，疏刪細(xì)弱枝條，控制結(jié)果部位外移，使養(yǎng)分集中以增加樹勢，在內(nèi)堂培育強(qiáng)壯的結(jié)果母枝，呈現(xiàn)全樹內(nèi)外立體結(jié)果。
對生長過旺的大樹，應(yīng)適當(dāng)多留枝條，以分散樹體養(yǎng)分。緩和長勢，增加強(qiáng)旺的結(jié)果母枝，使期能高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)，對這類樹要注意疏刪過密枝，使內(nèi)堂的枝組能充分，受到光照，切忌重縮重截。

原料的處理主要是除果皮、去棗核。南酸棗去皮通常采用沸水煮至果皮開裂，人工去皮后放在高速攪拌機(jī)中攪打分離果核。這一工序的關(guān)鍵技術(shù)是在沸水煮果時，應(yīng)確保果實(shí)的內(nèi)部溫度升到75攝氏度以上，有足夠的溫度而達(dá)到果肉護(hù)色、果皮和果肉分離的雙重效果。這一操作過程中，所有的容器、工具及與棗肉相接觸的表面均要求使用不銹鋼材料，棗果不能與含有鐵的材料接觸（這是因?yàn)楣麑?shí)的含酸較高，會使與其接觸的鐵器腐蝕，果肉在鐵離子的作用下，色澤變深甚至變黑）。廠家收購農(nóng)戶處理好的南酸棗果肉，應(yīng)對農(nóng)戶提出要求，否則收購的果肉在存放過程會變黑，造成浪費(fèi)。