農(nóng)家肥：
區(qū)別：
1）生物有機(jī)肥完全腐熟，蟲卵率達(dá)到95%以上；農(nóng)家肥堆放簡單，蟲卵率低。
2）生物有機(jī)肥無臭；農(nóng)家肥有惡臭。
3）生物有機(jī)肥施用方便，均勻；農(nóng)家肥施用不方便，肥料施用不均勻。
4 與生物菌肥：
區(qū)別：
1）生物有機(jī)肥價(jià)格便宜，每噸在千元左右；生物菌劑價(jià)格昂貴，每噸幾千元。
2）生物有機(jī)肥含有功能菌和有機(jī)質(zhì)，能改良土壤促進(jìn)被土壤固定養(yǎng)分的釋放；生物菌肥只含有功能菌，通過功能菌來促進(jìn)土壤固定肥料的利用。
3）生物有機(jī)肥的有機(jī)質(zhì)本身就是功能菌生活的環(huán)境，施入土壤后容易存活；而生物菌肥的功能菌可能不適合有的土壤環(huán)境。

生物有機(jī)無機(jī)肥運(yùn)用后可改進(jìn)農(nóng)產(chǎn)質(zhì)量量，前進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品安全性，增強(qiáng)作物本身抗逆性，削減農(nóng)藥的運(yùn)用，是開展現(xiàn)代生態(tài)農(nóng)業(yè)的有用方法，大力開展推行運(yùn)用，能有用處理秸稈、畜禽糞便等農(nóng)業(yè)面源污染物對(duì)環(huán)境形成污染?！昂芏噙\(yùn)用有機(jī)肥料，可添加土壤中有機(jī)質(zhì)和腐殖酸的含量。有機(jī)肥料就是好的土壤修正劑?！?br/>
目前，國內(nèi)現(xiàn)有的一些畜禽糞便發(fā)酵技術(shù)普遍存在著發(fā)酵，遠(yuǎn)距離運(yùn)輸，集中處理高成本的問題。同時(shí)因?yàn)榘l(fā)酵工藝落后，占地面積大，發(fā)酵過程中因發(fā)酵工藝落后造成地下水的污染和因發(fā)酵不全產(chǎn)生的氣味，使蚊蠅滋生對(duì)周圍環(huán)境產(chǎn)生嚴(yán)重影響。同時(shí)發(fā)酵生產(chǎn)受氣候影響嚴(yán)重，雨雪天無常工作，冬季因低溫導(dǎo)致設(shè)備無法處理糞便的現(xiàn)象。發(fā)酵時(shí)間普遍長達(dá)1-2個(gè)月，耗費(fèi)工作人員數(shù)量多。