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雖然有機肥的成分種類較多，但是每種養(yǎng)分的含量相對較少，并且病菌較多。需要存放腐熟以殺滅病菌、并與化學(xué)肥料配合使用，效果更好。
隨著科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展，通過有益菌群的人工篩選、分離、馴化培養(yǎng)技術(shù)，將有益菌群接入無害化處理后有機肥中，可以生產(chǎn)出多種多樣不同品種的生物有機肥，它能改善土質(zhì)、減少環(huán)境污染、增肥增效等。
有機農(nóng)業(yè)中使用的有機肥需經(jīng)過有機認證機構(gòu)的認證，符合產(chǎn)品的生產(chǎn)標準。近些年來，我國各種生物肥料發(fā)展迅速，年產(chǎn)量達數(shù)十萬噸以上。這些生物肥料以科技含量較高、增產(chǎn)效果明顯和為主要特點，它的生產(chǎn)、推廣和應(yīng)用對增進土壤肥力，提高農(nóng)作物產(chǎn)量，改善農(nóng)作物品質(zhì)和切實推行農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展都有積極意義。 針對生物肥料在生產(chǎn)、產(chǎn)品質(zhì)量和使用等方面存在的問題，本刊記者采訪了江西農(nóng)業(yè)大學(xué)高勇生教授，旨在提高農(nóng)村廣大群眾對這類肥料的認識，更加正確、科學(xué)地使用這些肥料，以促進我國生物肥料的健康發(fā)展。

生物有機肥是指特定功用微生物與主要以動植物殘體(如畜禽糞便、農(nóng)作物秸稈等)為來歷并經(jīng)無害化處理、腐熟的有機物料復(fù)合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應(yīng)的肥料。和化肥比較，生物有機肥營養(yǎng)元素完全，具有改善土壤、進步產(chǎn)品品質(zhì)、改善作物根際微生物群、進步植物的抗病蟲才能、進步化肥使用率等特色，深受農(nóng)喜歡。可是，在近年來生物有機肥出產(chǎn)經(jīng)銷和實踐使用中，卻呈現(xiàn)了一系列亟待解決的問題，詳細如下：

看有機肥料外觀顏色，物理方法干燥的有機肥料，仍保持原糞便的顏色，只是水分減少，通過堆肥技術(shù)處理的有機肥料腐熟后顏色變?yōu)楹稚蚝诤稚?，在成品中沒有其它雜質(zhì)。 二摸：用手抓一把有機肥料，其手感一致，濕時柔軟有彈性，干時很脆，容易破碎，劣質(zhì)有機肥料用手可以摸到雜質(zhì)，特別是沙子。 三水泡：拿兩杯清水，分別放入一些和低劣有機肥料，幾分鐘就可分辨出真?zhèn)?。有機肥料摻假一般是加入沙子或土來增加重量。有機肥料在水中分布均勻，而劣質(zhì)有機肥料的杯底沉入很多沙子或土，區(qū)別明顯。