集裝箱運輸的管理方法和工作體系與傳統(tǒng)運輸方式不同，其主要的關系方有集裝箱運輸經營人、無船承運人(NVOCC)、實際承運人、集裝箱租賃公司、集裝箱碼頭（堆場）和貨運站。

簡化包裝，大量節(jié)約包裝費用。為避免貨物在運輸途中受到損壞，有堅固的包裝，而集裝箱具有堅固、密封的特點，其本身就是一種的包裝。使用集裝箱可以簡化包裝，有的甚至無須包裝，實現件雜貨無包裝運輸，可大大節(jié)約包裝費用。

普通貨船裝卸，一般每小時為35t左右，而集裝箱裝卸，每小時可達400t左右，裝卸效率大幅度提高。同時，由于集裝箱裝卸機械化程度很高，因而每班組所需裝卸工人數很少，平均每個工人的勞動生產率大大提高。

集裝箱運輸涉及面廣、環(huán)節(jié)多、影響大，是一個復雜的運輸系統(tǒng)工程。集裝箱運輸系統(tǒng)包括海運、陸運、空運、港口、貨運站以及與集裝箱運輸有關的海關、商檢、船舶代理公司、貨運代理公司等單位和部門。如果互相配合不當，就會影響整個運輸系統(tǒng)功能的發(fā)揮，如果某一環(huán)節(jié)失誤，必將影響全局，甚至導致運輸生產停頓和中斷。因此，要求搞好整個運輸系統(tǒng)各環(huán)節(jié)、各部門之間的高度協(xié)作。

由于集裝箱運輸在不同運輸方式之間換裝時，勿需搬運箱內貨物而只需換裝集裝箱，這就提高了換裝作業(yè)效率，適于不同運輸方式之間的聯合運輸。在換裝轉運時，海關及有關監(jiān)管單位只需加封或驗封轉關放行，從而提高了運輸效率。

由于國際集裝箱運輸與多式聯運是一個資金密集、技術密集及管理要求很高的行業(yè)，是一個復雜的運輸系統(tǒng)工程，這就要求管理人員、技術人員、業(yè)務人員等具有較高的素質，才能勝任工作，才能充分發(fā)揮國際集裝箱運輸的性。